日前，在2010年度國家科學技術獎勵大會上，由中交第二航務工程局有限公司等單位完成的“千米級斜拉橋結構體系、設計及施工控制關鍵技術”喜獲國家科學技術進步一等獎，這是他們獲得的第4個國家科學技術進步獎。
中交二航局通過“引進、吸收再創新——技術嫁接——自主創新——前瞻性研究”，保持并不斷培育、發展核心技術，形成一批具有國際領先和國際先進水平的施工技術和工藝，產業鏈不斷得到延伸、拓展。在早期，中交二航局就開始引進、吸收再創新，創造了多項水工施工先進技術，為中國港口建設作出較大貢獻。1991年到2010年，中交二航局僅在長江上承建或參建的特大橋就多達30座。
中交二航局將建橋技術反哺水工施工。在長江口深水航道治理工程中，該局自行研制我國第一艘自升式拋石整平船“航工平1號”并獲國家專利。在潤揚大橋建設中，該局通過自主創新，取得8項“國際領先”或“國內領先”的前沿技術成果。2010年8月，該局作為主要單位參與完成的《千米級斜拉橋結構體系、設計及施工控制關鍵技術》創新成果通過國家科技進步獎評審，現已被評為國家科學技術一等獎。目前，中交二航局與國內外20余家相關行業的頂級企業和科研院所建立牢固的合作關系，實行“產學研”鏈條式開發，近年來共獲得省部級以上科技進步獎48項。
中交二航局不斷加快改革步伐，1995年，該局產值突破了10億元。2002年，中交二航局完成了由局、公司兩級法人架構向局一級法人架構的轉變，獲得公路工程施工總承包特級資質。2003年，中交二航局提出“創新企業文化，打造百年二航”的宏偉愿景，并頒布《二航局企業文化發展大綱》。2005年，二分公司、三分公司相繼成功改制為有限公司，中交二航局的企業結構已形成總分公司體系和母子公司體系并存的混合架構。2006年，中交二航局改制為有限公司。2007年，中交二航局再次獲得港口與航道工程施工總承包特級資質，由此成為全國擁有“雙特級”資質的8家企業之一。
繼1998年通過ISO9001質量管理體系認證之后，該局于2003年又成為原中港集團系統內第一家通過質量、環境和職業安全健康管理體系一體化認證的單位，走在了國內建筑企業的前列。中交二航局還建立了以“用友管理軟件”、“項目管理軟件”等為核心的信息化管理平臺。
2004年，中交二航局又成功導入卓越績效模式，建立“以顧客為中心”的卓越績效管理體系。兩年后，該局獲得中國質量管理領域最高獎——“全國質量獎”，是全國第一家獲得“全國質量獎”的路橋建設企業，從而確立了中交二航局在中國橋梁建設市場的標桿地位。
為建立起強有力的公司總部管理平臺，中交二航局于2007年建立了技術、資金管理、采購交易三大職能中心，企業的技術、資金、設備設施、建筑材料、分包商等資源得到最優化的整合和配置，為該局的可持續發展提供了重要的基礎保障。同時，該局積極建設海外、投資和鐵路三大事業部，拓展新的經濟增長點，進而轉變贏利模式。
